El conflicto entre Colombia y Perú por la soberanía en la isla Santa Rosa se acentuó a partir de varios incidentes. La Marina de Guerra y el Ejército del Perú intensificaron el patrullaje en la isla después de que se colocara una bandera de Colombia en la localidad. El Ministerio de Relaciones Exteriores del Perú solicitó formalmente a Colombia «detener las provocaciones», mientras que Gustavo Petro, presidente de Colombia, afirmó que su gobierno no reconocía la soberanía peruana sobre la isla, ni a las autoridades allí asentadas. Además, la Policía Nacional del Perú (PNP) detuvo a dos topógrafos colombianos que realizaban mediciones en la zona con GPS satelital, lo que llevó a Petro a calificar la acción como un «secuestro».

El conflicto diplomático continuó escalando, llevando a incidentes como la denuncia peruana de una violación de su espacio aéreo por parte de una aeronave militar colombiana. Petro insistió en que el espíritu del tratado con Perú era que Colombia tuviera acceso al río Amazonas y anunció que llevaría el caso a una comisión mixta para demostrar que la isla nunca fue adjudicada a Perú. Por su parte, la población de Santa Rosa izó la bandera peruana y cantó el himno nacional, mientras que Petro descartó su presencia en la zona para «evitar la guerra«.

Finalmente, la disputa por la soberanía de la isla escaló al más alto nivel con la visita de la presidenta Dina Boluarte al distrito en cuestión, en Loreto. Perú reafirma que no hay ningún tema en discusión y que Colombia sólo debe respetar su integridad territorial.